Axe 1: OMICs des modifications post-traductionnelles bactériennes.
Coordinateurs: Céline HENRY (Jouy-en-Josas) et Yann GUERARDEL (Lille)
L’objectif principal de l’axe de recherche 1 est de mutualiser les méthodologies et les technologies mises en place de manière individuelle pour améliorer l’analyse des PTMs bactériennes. Les points critiques de ces échanges scientifiques porteront sur la définition de protocoles d’extraction, d’enrichissement et d’analyse par spectrométrie de masse qui seront mutualisés entre les différents groupes pour un meilleur contrôle-qualité des résultats finaux. Une des richesses de ce GDR est la diversité des PTMs étudiées. Elles permettent d’envisager des échanges et des projets collaboratifs pour mieux caractériser les PTMs d’un organisme.
Axe 2: étudier l’implication des PTMs dans la régulation de la physiologie bactérienne.
Coordinateurs: Anne GALINIER (Marseille) et Séverine ZIRAH (Paris)
Etudier les PTMs et caractériser leur rôle dans la régulation de la physiologie bactérienne sont les objectifs communs des équipes impliquées dans l’axe 2. La phosphorylation des protéines, catalysée par des protéines kinases spécifiques de certains acides aminés, est la PTM la mieux connue et la plus étudiée chez les bactéries. Elle est impliquée dans différents processus cellulaires telles que la division cellulaire, la morphogenèse, la formation de capsule ou encore certaines étapes de leur développement comme la sporulation. D’autres PTMs bactériennes telles que la glycosylation ou les NPMs ont été mises en évidence plus récemment mais leurs rôles restent à ce jour peu étudiés. Enfin, les PTMs de peptides bactériens restent encore peu explorées; elles sont souvent impliquées dans les interactions microbiennes. Examiner les PTMs de façon ciblée par type de modification ou de façon globale en cherchant à caractériser, pour un processus cellulaire donné, des réseaux interconnectés impliquant différents types de PTMs, est un enjeu majeur de la microbiologie dans les années futures.
